ID | 154448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ppox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000062729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | protoporphyrinogen oxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.329) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 171104564-171108955 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 171108318 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Isoleucine to Lysine at position 6 (I6K) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000072863 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000064272] [ENSMUST00000065941] [ENSMUST00000073120] [ENSMUST00000111305] [ENSMUST00000111306] [ENSMUST00000111313] [ENSMUST00000126699] [ENSMUST00000149187] [ENSMUST00000192956] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P51175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000064272 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000066353 Gene: ENSMUSG00000052423
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000065941 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000064002 Gene: ENSMUSG00000053483
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000073120 AA Change: I6K PolyPhen 2 Score 0.293 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000072863 Gene: ENSMUSG00000062729 AA Change: I6K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111305 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106936 Gene: ENSMUSG00000053483
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111306 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106938 Gene: ENSMUSG00000053483
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111313 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106945 Gene: ENSMUSG00000052423
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126557 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132890 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126729 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151442 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145019 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147176 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129985 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152689 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144393 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126765 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133050 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127101 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142656 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126699 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141958 Gene: ENSMUSG00000052423
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149187 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120161 Gene: ENSMUSG00000053483
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000192956 AA Change: I6K PolyPhen 2 Score 0.003 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.44) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141835 Gene: ENSMUSG00000062729 AA Change: I6K
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000155083 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153164 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174720 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133362 Gene: ENSMUSG00000053483
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes the penultimate enzyme of heme biosynthesis, which catalyzes the 6-electron oxidation of protoporphyrinogen IX to form protoporphyrin IX. Mutations in this gene cause variegate porphyria, an autosomal dominant disorder of heme metabolism resulting from a deficiency in protoporphyrinogen oxidase, an enzyme located on the inner mitochondrial membrane. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice heterozygous for the R59W knock-in mutation exhibit elevated stool porphyrin levels and reduced hepatic protoporphyrinogen oxidase activity. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ppox |
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Posted On | 2014-02-04 |