ID | 157831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Uba52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000090137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D8Ertd21e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039373-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.899) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1307 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 70960913-70963067 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 70961166 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Histidine to Arginine at position 68 (H68R) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000122797 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000008032] [ENSMUST00000075175] [ENSMUST00000081940] [ENSMUST00000093456] [ENSMUST00000121623] [ENSMUST00000124967] [ENSMUST00000125184] [ENSMUST00000129909] [ENSMUST00000140679] [ENSMUST00000165126] [ENSMUST00000135446] [ENSMUST00000138260] [ENSMUST00000136913] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB Structure | Crystal structure of GFP-Wrnip1 UBZ domain fusion protein in complex with ubiquitin [X-RAY DIFFRACTION] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000008032 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000008032 Gene: ENSMUSG00000007888
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000075175 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000074670 Gene: ENSMUSG00000058833
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000081940 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000080608 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000093456 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000091165 Gene: ENSMUSG00000055553
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000121623 AA Change: H172R PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113804 Gene: ENSMUSG00000055553 AA Change: H172R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000124967 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122797 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000125184 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120096 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000129909 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121149 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000140679 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123263 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000165126 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137461 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000135446 AA Change: H68R PolyPhen 2 Score 0.969 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123562 Gene: ENSMUSG00000090137 AA Change: H68R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000138260 AA Change: H172R PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123438 Gene: ENSMUSG00000055553 AA Change: H172R
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133683 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128620 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132107 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135773 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127793 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000138196 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143598 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127983 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115614 Gene: ENSMUSG00000007888
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000136913 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120446 Gene: ENSMUSG00000058833
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Uba52 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- ACACCAATTACTGCTCCAGTGGATG -3' (R):5'- TTGACTTGTGCTCTCACCAGACTTG -3' Sequencing Primer (F):5'- GTCACATGCCAGGTATGACC -3' (R):5'- CAGACTTGTAAAGTTCCCAGGTG -3' |
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Posted On | 2014-02-18 |