ID | 178788 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lime1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000090077 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Lck interacting transmembrane adaptor 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2810038K19Rik, LIME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01873 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 181023028-181025421 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 181024667 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Alanine at position 107 (V107A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000045010 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029105] [ENSMUST00000029106] [ENSMUST00000048077] [ENSMUST00000108804] [ENSMUST00000108807] [ENSMUST00000116366] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9EQR5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029105 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029105 Gene: ENSMUSG00000027582
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029106 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029106 Gene: ENSMUSG00000027583
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000048077 AA Change: V107A PolyPhen 2 Score 0.005 (Sensitivity: 0.97; Specificity: 0.74) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000045010 Gene: ENSMUSG00000090077 AA Change: V107A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108804 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104432 Gene: ENSMUSG00000090077
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108807 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104435 Gene: ENSMUSG00000027582
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000116366 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112067 Gene: ENSMUSG00000027582
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000126611 AA Change: V86A |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119181 Gene: ENSMUSG00000090077 AA Change: V86A
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000140943 AA Change: V108A |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117558 Gene: ENSMUSG00000090077 AA Change: V108A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127559 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151457 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131284 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184328 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176590 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126862 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126733 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000156258 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122714 Gene: ENSMUSG00000027582
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a transmembrane adaptor protein that links the T and B-cell receptor stimulation to downstream signaling pathways via its association with the Src family kinases Lck and Lyn, respectively. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2015] PHENOTYPE: Mice homozygous for a targeted null allele exhibit no detectable abnormalities in the development and function of B and T cells. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Lime1 |
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Posted On | 2014-05-07 |