ID | 197508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc50a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 50 (sugar transporter), member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Rag1ap1, Rga | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | Y4338 () | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 89175553-89177877 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 89177417 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Glutamine at position 37 (R37Q) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000139128 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029565] [ENSMUST00000029566] [ENSMUST00000040824] [ENSMUST00000107460] [ENSMUST00000107462] [ENSMUST00000118587] [ENSMUST00000118860] [ENSMUST00000185119] [ENSMUST00000130230] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9CXK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029565 AA Change: R37Q PolyPhen 2 Score 0.018 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029565 Gene: ENSMUSG00000027953 AA Change: R37Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029566 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029566 Gene: ENSMUSG00000027954
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000040824 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000040860 Gene: ENSMUSG00000042737
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107460 AA Change: R37Q PolyPhen 2 Score 0.018 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103084 Gene: ENSMUSG00000027953 AA Change: R37Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107462 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103086 Gene: ENSMUSG00000042737
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000118587 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112904 Gene: ENSMUSG00000027954
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000118860 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113098 Gene: ENSMUSG00000027954
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000185119 AA Change: R37Q PolyPhen 2 Score 0.711 (Sensitivity: 0.86; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139128 Gene: ENSMUSG00000027953 AA Change: R37Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130230 AA Change: R5Q PolyPhen 2 Score 0.067 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123276 Gene: ENSMUSG00000027953 AA Change: R5Q
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148095 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133575 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132445 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137975 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144777 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130690 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Slc50a1 |
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Predicted Primers |
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Posted On | 2014-05-23 |