ID | 201473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000089953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gm757, LOC329360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038330-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.087) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0036 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 25124488-25126799 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 25126143 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Glutamine at position 70 (R70Q) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000145127 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000006638] [ENSMUST00000043379] [ENSMUST00000091318] [ENSMUST00000114356] [ENSMUST00000205192] [ENSMUST00000186719] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q3UIW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000006638 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000006638 Gene: ENSMUSG00000006469
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000043379 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000045363 Gene: ENSMUSG00000036731
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000091318 AA Change: R70Q PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088868 Gene: ENSMUSG00000089953 AA Change: R70Q
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000091318 AA Change: R70Q PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145470 Gene: ENSMUSG00000089953 AA Change: R70Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114356 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109996 Gene: ENSMUSG00000036731
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000124146 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137482 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000205192 AA Change: R70Q PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145127 Gene: ENSMUSG00000089953 AA Change: R70Q
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152997 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000155420 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144884 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142095 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000186719 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140416 Gene: ENSMUSG00000036731
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Meta Mutation Damage Score | 0.6467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 97% (33/34) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rnf224 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGGCTCGAAATGTTCCTGGTCAAG -3' (R):5'- ACGGAATGACTGCATCATCTGCTAC -3' Sequencing Primer (F):5'- TTCCTGGTCAAGGTGACAC -3' (R):5'- ATCATCTGCTACTCTGCCTATGAC -3' |
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Posted On | 2014-06-13 |