ID | 237935 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Myl6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000090841 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | myosin, light polypeptide 6, alkali, smooth muscle and non-muscle | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MLC3NM, MLC3nm, Myln | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040190-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.350) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2188 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 218 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 128326728-128329755 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 128328566 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Isoleucine to Threonine at position 27 (I27T) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000151915 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000026428] [ENSMUST00000026433] [ENSMUST00000099131] [ENSMUST00000105235] [ENSMUST00000164181] [ENSMUST00000217733] [ENSMUST00000217776] [ENSMUST00000218127] [ENSMUST00000219236] [ENSMUST00000217969] [ENSMUST00000220307] [ENSMUST00000220427] [ENSMUST00000218228] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q60605 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000026428 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000026428 Gene: ENSMUSG00000039824
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000026433 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000026433 Gene: ENSMUSG00000025369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000099131 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000096734 Gene: ENSMUSG00000025369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105235 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000100868 Gene: ENSMUSG00000025369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164181 AA Change: I27T PolyPhen 2 Score 0.110 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128803 Gene: ENSMUSG00000090841 AA Change: I27T
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000217733 AA Change: I27T PolyPhen 2 Score 0.600 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000217776 AA Change: I27T PolyPhen 2 Score 0.908 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000218127 AA Change: I27T PolyPhen 2 Score 0.110 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000219236 AA Change: I27T PolyPhen 2 Score 0.908 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000217969 AA Change: I15T PolyPhen 2 Score 0.132 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000220307 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218813 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219655 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000220427 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219100 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219554 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218250 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218713 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218170 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000218228 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000217913 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Myosin is a hexameric ATPase cellular motor protein. It is composed of two heavy chains, two nonphosphorylatable alkali light chains, and two phosphorylatable regulatory light chains. This gene encodes a myosin alkali light chain that is expressed in smooth muscle and non-muscle tissues. Genomic sequences representing several pseudogenes have been described and two transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Myl6 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGCTCAAGTTTGGCACCTATG -3' (R):5'- AAAGAAGGTTGCCTGTCTTTATGTG -3' Sequencing Primer (F):5'- TATGCAGATAAAGGGATGACTTTAGC -3' (R):5'- AATAGATCCCTAGGAGTAGTCTTGTG -3' |
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Posted On | 2014-10-02 |