ID | 245612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rpl4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein L4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010004J23Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.965) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2320 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 64080657-64085948 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 64082881 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Cysteine at position 100 (R100C) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000034966 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000034965] [ENSMUST00000034966] [ENSMUST00000176299] [ENSMUST00000176378] [ENSMUST00000176794] [ENSMUST00000122091] [ENSMUST00000130127] [ENSMUST00000177045] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9D8E6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000034965 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000034965 Gene: ENSMUSG00000032398
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000034966 AA Change: R100C PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000034966 Gene: ENSMUSG00000032399 AA Change: R100C
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082580 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082984 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083425 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083818 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083895 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151428 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176299 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135585 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176378 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134782 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000213760 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176794 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134850 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122091 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112790 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000124301 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134966 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130127 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116187 Gene: ENSMUSG00000032400
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000217055 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000177045 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135328 Gene: ENSMUSG00000032400
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L4E family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rpl4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGGGAACTTGCAGTGATGTC -3' (R):5'- AGTGACTTTAGCAGGCAGAG -3' Sequencing Primer (F):5'- AACTTGCAGTGATGTCGTAATTTGC -3' (R):5'- TGACTTTAGCAGGCAGAGAGAAAC -3' |
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Posted On | 2014-10-30 |