ID | 250546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zgpat | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger, CCCH-type with G patch domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Is this an essential gene? |
Non essential
(E-score: 0.000)
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Stock # | R2445 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 181364928-181383628 bp(+) (GRCm38) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | nonsense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 181366160 bp (GRCm38) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Cysteine to Stop codon at position 163 (C163*) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000112067 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029105] [ENSMUST00000108807] [ENSMUST00000108808] [ENSMUST00000116366] [ENSMUST00000127988] [ENSMUST00000170190] [ENSMUST00000183499] [ENSMUST00000185118] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8VDM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000029105 AA Change: C163* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029105 Gene: ENSMUSG00000027582 AA Change: C163*
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000048269 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000108807 AA Change: C163* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104435 Gene: ENSMUSG00000027582 AA Change: C163*
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108808 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104436 Gene: ENSMUSG00000038671
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000116366 AA Change: C163* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112067 Gene: ENSMUSG00000027582 AA Change: C163*
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127988 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122066 Gene: ENSMUSG00000038671
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130346 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131284 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000139368 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145358 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152580 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000170190 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126387 Gene: ENSMUSG00000038671
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000183499 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138941 Gene: ENSMUSG00000038671
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184859 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000185118 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139211 Gene: ENSMUSG00000038671
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zgpat |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TTTCCAGAAGGCCATTGCG -3' (R):5'- AAACTAGTTGTGGCGACAGG -3' Sequencing Primer (F):5'- CCTGCAATGACTCGGAGAC -3' (R):5'- GACAGGCCACAGCGGTG -3' |
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Posted On | 2014-11-12 |