ID | 257122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rccd1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RCC1 domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | E430018M08Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2983 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 79944339-79974512 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | nonsense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 79970276 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glutamine to Stop codon at position 114 (Q114*) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000113273 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032748] [ENSMUST00000047362] [ENSMUST00000047558] [ENSMUST00000107368] [ENSMUST00000121882] [ENSMUST00000123189] [ENSMUST00000174199] [ENSMUST00000173824] [ENSMUST00000163812] [ENSMUST00000174172] [ENSMUST00000154428] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8BTU7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032748 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032748 Gene: ENSMUSG00000030533
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000047362 AA Change: Q114* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000048043 Gene: ENSMUSG00000038930 AA Change: Q114*
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000047558 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000043379 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107368 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102991 Gene: ENSMUSG00000030533
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121882 AA Change: Q114* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113273 Gene: ENSMUSG00000038930 AA Change: Q114*
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000123109 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123189 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148001 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000155124 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206363 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130888 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134288 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144685 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000205863 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174199 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133295 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173824 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133910 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174051 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134262 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000163812 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129675 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174172 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133387 Gene: ENSMUSG00000038943
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154428 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119665 Gene: ENSMUSG00000030533
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rccd1 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TCCAAGAGAGCCTCTCCTTG -3' (R):5'- CTCCTAACATGCCAGTCCAG -3' Sequencing Primer (F):5'- AAGAGAGCCTCTCCTTGAGCTC -3' (R):5'- TTCCCAGGTCCATGGCATG -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |