ID | 257207 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Myg1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | melanocyte proliferating gene 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gamm1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.255) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2997 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 102240144-102246574 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 102245945 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Leucine at position 315 (R315L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000109312 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000001331] [ENSMUST00000041208] [ENSMUST00000113682] [ENSMUST00000229900] [ENSMUST00000228959] [ENSMUST00000231061] [ENSMUST00000230481] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JK81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000001331 AA Change: R261L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001331 Gene: ENSMUSG00000001285 AA Change: R261L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000041208 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000044604 Gene: ENSMUSG00000036678
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113682 AA Change: R315L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109312 Gene: ENSMUSG00000001285 AA Change: R315L
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000164019 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000164961 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000168547 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170078 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000171244 AA Change: R269L |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129494 Gene: ENSMUSG00000001285 AA Change: R269L
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170713 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170281 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000171733 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229900 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000228959 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231061 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230481 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230239 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230812 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229315 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230406 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229589 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230710 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000231099 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a null mutation display no gross abnormalities but altered sex-dependent anxiety-like behaviors in different tests. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Myg1 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CCTTTCAGGTAGATTCAAGTGGGG -3' (R):5'- GCATGGACGAAGATGCAACC -3' Sequencing Primer (F):5'- TTCAAGTGGGGAAATAGTGGAACTC -3' (R):5'- GATCCCACTGACTTGGTCCAG -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |