ID | 257408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Exosc8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310032N20Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3005 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 54636099-54642469 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 54639568 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000118780 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029315] [ENSMUST00000029316] [ENSMUST00000044567] [ENSMUST00000153224] [ENSMUST00000153224] [ENSMUST00000154787] [ENSMUST00000155273] [ENSMUST00000141191] [ENSMUST00000197502] [ENSMUST00000199674] [ENSMUST00000200439] [ENSMUST00000200441] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9D753 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029315 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029315 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000029316 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029316 Gene: ENSMUSG00000027752
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000044567 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000035879 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125632 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127112 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134892 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140935 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000153224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118780 Gene: ENSMUSG00000027752
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000153224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118780 Gene: ENSMUSG00000027752
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000154787 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115876 Gene: ENSMUSG00000027752
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150923 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135935 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143387 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198780 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142377 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155273 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119260 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141191 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118818 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000197502 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143750 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000199674 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142948 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200439 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143059 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200441 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143231 Gene: ENSMUSG00000027751
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a 3'-5' exoribonuclease that specifically interacts with mRNAs containing AU-rich elements. The encoded protein is part of the exosome complex that is important for the degradation of numerous RNA species. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. [provided by RefSeq, Mar 2009] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Exosc8 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TACCTTGCCTGGAGAAATGC -3' (R):5'- TTTCCATAGGTGGGAAACAGC -3' Sequencing Primer (F):5'- CTTGCCTGGAGAAATGCATAAATCC -3' (R):5'- TTGGATGTGAGCAAAGAGTCTACCC -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |