ID | 258070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Polg2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | polymerase (DNA directed), gamma 2, accessory subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040610-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3159 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 106659079-106670363 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to C at 106659163 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Glycine at position 450 (V450G) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000021060 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000021060] [ENSMUST00000086353] [ENSMUST00000106794] [ENSMUST00000127061] [ENSMUST00000134029] [ENSMUST00000147326] [ENSMUST00000182023] [ENSMUST00000183111] [ENSMUST00000182479] [ENSMUST00000182896] [ENSMUST00000182908] [ENSMUST00000155107] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9QZM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB Structure |
CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA [X-RAY DIFFRACTION]
CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACCESSORY SUBUNIT OF MURINE MITOCHONDRIAL POLYMERASE GAMMA [X-RAY DIFFRACTION] |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000021060 AA Change: V450G PolyPhen 2 Score 0.401 (Sensitivity: 0.89; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000021060 Gene: ENSMUSG00000020718 AA Change: V450G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000086353 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000083538 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106794 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102406 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127061 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117441 Gene: ENSMUSG00000020718
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000134029 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122755 Gene: ENSMUSG00000020718
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142590 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147326 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138742 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000157775 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000182023 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138286 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000183111 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138513 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000182479 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138386 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000182896 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138617 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000182908 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138678 Gene: ENSMUSG00000040528
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155107 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118975 Gene: ENSMUSG00000020718
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes the processivity subunit of the mitochondrial DNA polymerase gamma. The encoded protein forms a heterotrimer containing one catalytic subunit and two processivity subunits. This protein enhances DNA binding and promotes processive DNA synthesis. Mutations in this gene result in autosomal dominant progressive external ophthalmoplegia with mitochondrial DNA deletions.[provided by RefSeq, Sep 2009] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit embryonic lethality between somite formation and turning, fail to initiate turning, lack mt-Co1 activity, and contain abnormal mitochondria with reduced mtDNA. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Polg2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGACACACGTACTCCAAGGC -3' (R):5'- CATGAGATGAGGAGCTGATGTCTG -3' Sequencing Primer (F):5'- TGAAACTCCGTGGGGCCATATTC -3' (R):5'- AGGAGCTGATGTCTGCCCAG -3' |
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Posted On | 2015-01-23 |