ID | 26526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clk4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CDC like kinase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.712) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | K7894 () of strain 468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated (trace) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 51153941-51172597 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | unclassified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 51166593 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000115894 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000093132] [ENSMUST00000109111] [ENSMUST00000109113] [ENSMUST00000126131] [ENSMUST00000130641] [ENSMUST00000153414] [ENSMUST00000148053] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | O35493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000093132 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000090820 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000109111 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104739 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000109113 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104741 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126131 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118972 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130641 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123133 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136587 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140628 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147007 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148467 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143468 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146776 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153414 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115894 Gene: ENSMUSG00000020385
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000148053 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120822 Gene: ENSMUSG00000020385
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 88% (22/25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene belongs to the CDC2-like protein kinase (CLK) family. This protein kinase can interact with and phosphorylate the serine- and arginine-rich (SR) proteins, which are known to play an important role in the formation of spliceosomes, and thus may be involved in the regulation of alternative splicing. Studies in the Israeli sand rat Psammomys obesus suggested that the ubiquitin-like 5 (UBL5/BEACON), a highly conserved ubiquitin-like protein, may interact with and regulate the activity of this kinase. Multiple alternatively spliced transcript variants have been observed, but the full-length natures of which have not yet been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Clk4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGGAGCACTTGAACAGCACTGACC -3' (R):5'- AGGCTTGCAAATGAACCCTCCC -3' Sequencing Primer (F):5'- CATCAGGCAAATGGCTTATCAG -3' (R):5'- GGATACACACATCCTATTCATATTCC -3' |
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Posted On | 2013-04-16 |