ID | 283873 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pfn1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | profilin 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Pfn, actin binding protein | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL02191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 70542676-70545470 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 70545209 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Alanine to Valine at position 33 (A33V) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000104189 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000018437] [ENSMUST00000037534] [ENSMUST00000072841] [ENSMUST00000108548] [ENSMUST00000108549] [ENSMUST00000126241] [ENSMUST00000178254] [ENSMUST00000157027] [ENSMUST00000152160] [ENSMUST00000134087] [ENSMUST00000141695] [ENSMUST00000170716] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P62962 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000018437 AA Change: A33V PolyPhen 2 Score 0.914 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000018437 Gene: ENSMUSG00000018293 AA Change: A33V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000037534 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000036472 Gene: ENSMUSG00000040746
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000072841 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000072620 Gene: ENSMUSG00000060600
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108548 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104188 Gene: ENSMUSG00000060600
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000108549 AA Change: A33V PolyPhen 2 Score 0.980 (Sensitivity: 0.75; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104189 Gene: ENSMUSG00000018293 AA Change: A33V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126241 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123688 Gene: ENSMUSG00000060600
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131642 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000178254 AA Change: A33V PolyPhen 2 Score 0.627 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000136219 Gene: ENSMUSG00000018293 AA Change: A33V
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177669 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152458 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151034 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000179738 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000141237 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143313 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152276 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000157027 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115726 Gene: ENSMUSG00000060600
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152160 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115057 Gene: ENSMUSG00000040746
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000134087 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121640 Gene: ENSMUSG00000060600
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141695 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121511 Gene: ENSMUSG00000040746
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000170716 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128714 Gene: ENSMUSG00000060600
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the profilin family of small actin-binding proteins. The encoded protein plays an important role in actin dynamics by regulating actin polymerization in response to extracellular signals. Deletion of this gene is associated with Miller-Dieker syndrome, and the encoded protein may also play a role in Huntington disease. Multiple pseudogenes of this gene are located on chromosome 1. [provided by RefSeq, Jul 2012] PHENOTYPE: Homozygous mice die at early embryonic stages. Some heterozygous mice die either in early embryonic stages or in the perinatal period; animals that survive reach adulthood and are phenotypically normal. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pfn1 |
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Posted On | 2015-04-16 |