ID | 287767 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pip4p1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000035953 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Tmem55b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.314) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL02310 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 51164672-51168306 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 51166667 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Alanine at position 187 (T187A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000124259 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000006452] [ENSMUST00000049312] [ENSMUST00000049411] [ENSMUST00000128395] [ENSMUST00000136753] [ENSMUST00000154288] [ENSMUST00000160538] [ENSMUST00000160835] [ENSMUST00000161166] [ENSMUST00000162957] [ENSMUST00000162177] [ENSMUST00000159292] [ENSMUST00000160393] [ENSMUST00000160890] [ENSMUST00000160375] [ENSMUST00000226871] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q3TWL2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000006452 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000006452 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000049312 AA Change: T180A PolyPhen 2 Score 0.316 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000038276 Gene: ENSMUSG00000035953 AA Change: T180A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000049411 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000042602 Gene: ENSMUSG00000035960
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128395 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116319 Gene: ENSMUSG00000035960
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000136753 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123148 Gene: ENSMUSG00000035960
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154288 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122343 Gene: ENSMUSG00000035960
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159047 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000160538 AA Change: T187A PolyPhen 2 Score 0.832 (Sensitivity: 0.84; Specificity: 0.93) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124259 Gene: ENSMUSG00000035953 AA Change: T187A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160835 AA Change: T187A PolyPhen 2 Score 0.316 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124782 Gene: ENSMUSG00000035953 AA Change: T187A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159745 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000163043 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162935 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160464 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161166 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125414 Gene: ENSMUSG00000035953
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162957 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123697 Gene: ENSMUSG00000035953
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162177 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124016 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159292 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124039 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160393 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125155 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161669 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160890 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124659 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160375 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124099 Gene: ENSMUSG00000006289
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000163088 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000226871 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] TMEM55B catalyzes the degradation of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PtdIns-4,5-P2) by removing the 4-phosphate (Ungewickell et al., 2005 [PubMed 16365287]).[supplied by OMIM, Mar 2008] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pip4p1 |
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Posted On | 2015-04-16 |