ID | 293272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tex30 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | testis expressed 30 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700029F09Rik, 3110030D08Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.127) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL02436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 44125773-44141601 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site (3 bp from exon) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 44127665 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000115939 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000027215] [ENSMUST00000125540] [ENSMUST00000127923] [ENSMUST00000128190] [ENSMUST00000129702] [ENSMUST00000133677] [ENSMUST00000143327] [ENSMUST00000147571] [ENSMUST00000152239] [ENSMUST00000156392] [ENSMUST00000150911] [ENSMUST00000149502] [ENSMUST00000147661] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q3TUU5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000027215 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000027215 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000125540 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121385 Gene: ENSMUSG00000026049
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000127923 AA Change: E49G PolyPhen 2 Score 0.640 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128190 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117565 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129702 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115464 Gene: ENSMUSG00000026049
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133677 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115068 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134195 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000143327 AA Change: E49G PolyPhen 2 Score 0.954 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147571 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114624 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152239 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114991 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000156392 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121035 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000150911 AA Change: E90G PolyPhen 2 Score 0.105 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120928 Gene: ENSMUSG00000026049 AA Change: E90G
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000149502 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115939 Gene: ENSMUSG00000026049
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000147661 AA Change: E13G PolyPhen 2 Score 0.835 (Sensitivity: 0.84; Specificity: 0.93) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148542 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tex30 |
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Posted On | 2015-04-16 |