ID | 309264 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hyal1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000010051 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | hyaluronoglucosaminidase 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Hyal-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040907-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.103) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3903 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 107454149-107458898 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice donor site (2 bp from exon) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 107456171 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000139004 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000010195] [ENSMUST00000040059] [ENSMUST00000093785] [ENSMUST00000112387] [ENSMUST00000122985] [ENSMUST00000123005] [ENSMUST00000127380] [ENSMUST00000130053] [ENSMUST00000139274] [ENSMUST00000139581] [ENSMUST00000149638] [ENSMUST00000144392] [ENSMUST00000148440] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q91ZJ9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000010195 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000010195 Gene: ENSMUSG00000010051
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000040059 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000042667 Gene: ENSMUSG00000036091
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000093785 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000091300 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000112387 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000108006 Gene: ENSMUSG00000010051
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000122985 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122807 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000123005 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122601 Gene: ENSMUSG00000010051
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000127380 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116378 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000130053 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114490 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000139274 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138933 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000139581 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122321 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000149638 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139004 Gene: ENSMUSG00000079334
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184695 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162027 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144392 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120599 Gene: ENSMUSG00000010051
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000148440 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119499 Gene: ENSMUSG00000036091
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Meta Mutation Damage Score | 0.9493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (32/32) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a lysosomal hyaluronidase. Hyaluronidases intracellularly degrade hyaluronan, one of the major glycosaminoglycans of the extracellular matrix. Hyaluronan is thought to be involved in cell proliferation, migration and differentiation. This enzyme is active at an acidic pH and is the major hyaluronidase in plasma. Mutations in this gene are associated with mucopolysaccharidosis type IX, or hyaluronidase deficiency. The gene is one of several related genes in a region of chromosome 3p21.3 associated with tumor suppression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Homozygous null mice display a progressive osteoarthritis associated with bony outgrowths, early loss of articular cartilage proteoglycans and accumulation of hyaluronan (HA) in the cartilage of knee joints, but show no signs of non-skeletal tissue GAG accumulation or increased serum HA levels. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Hyal1 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GCCTCAGGTGAAGGTTAGAG -3' (R):5'- ACTGGTCACGTTCACGATGAAG -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGATTATTTGTCCCATCCAGTGATG -3' (R):5'- TTCACGATGAAGGGCCCAAG -3' |
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Posted On | 2015-04-17 |