ID | 323583 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Fcrla | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038421 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Fc receptor-like A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mFREB, Freb1, Fcrx, mFcrX, FREB, FCRL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4331 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 170745163-170755169 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 170749245 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Glutamine at position 96 (R96Q) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000125074 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000046322] [ENSMUST00000159149] [ENSMUST00000159171] [ENSMUST00000162136] [ENSMUST00000162887] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q920A9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000046322 AA Change: R125Q PolyPhen 2 Score 0.115 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000036380 Gene: ENSMUSG00000038421 AA Change: R125Q
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000159149 AA Change: R96Q PolyPhen 2 Score 0.738 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125074 Gene: ENSMUSG00000038421 AA Change: R96Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159171 AA Change: R124Q PolyPhen 2 Score 0.125 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124853 Gene: ENSMUSG00000038421 AA Change: R124Q
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159266 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161050 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162136 AA Change: R99Q PolyPhen 2 Score 0.192 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124859 Gene: ENSMUSG00000038421 AA Change: R99Q
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162887 AA Change: R63Q PolyPhen 2 Score 0.009 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.77) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124469 Gene: ENSMUSG00000038421 AA Change: R63Q
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a protein similar to receptors for the Fc fragment of gamma immunoglobulin (IgG). These receptors, referred to as FCGRs, mediate the destruction of IgG-coated antigens and of cells induced by antibodies. This encoded protein is selectively expressed in B cells, and may be involved in their development. This protein may also be involved in the development of lymphomas. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] PHENOTYPE: Mice homozygous for a targeted allele exhibit largely normal T-dependent and T-independent antibody responses with an increase in IgG1 after secondary challenge with sheep red blood cells. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Fcrla |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- ACCATAGATCTTGATGGTGCTGG -3' (R):5'- TGAACATTGCTTGGGACTTCC -3' Sequencing Primer (F):5'- ATAGATCTTGATGGTGCTGGTCTCTC -3' (R):5'- GGACTTCCTAAGGGATGCG -3' |
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Posted On | 2015-06-24 |