ID | 324078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Efemp2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | epidermal growth factor-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610011K11Rik, MBP1, fibulin-4, Fbln4, fibulin 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041658-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4307 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 5523982-5532545 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 5531649 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Asparagine at position 430 (Y430N) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000064719 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000025841] [ENSMUST00000070118] [ENSMUST00000124334] [ENSMUST00000126471] [ENSMUST00000167371] [ENSMUST00000165485] [ENSMUST00000168330] [ENSMUST00000167855] [ENSMUST00000166253] [ENSMUST00000167304] [ENSMUST00000167827] [ENSMUST00000169943] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9WVJ9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000025841 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000025841 Gene: ENSMUSG00000024906
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000070118 AA Change: Y430N PolyPhen 2 Score 0.824 (Sensitivity: 0.84; Specificity: 0.93) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000064719 Gene: ENSMUSG00000024909 AA Change: Y430N
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000124334 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114895 Gene: ENSMUSG00000024906
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126471 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121435 Gene: ENSMUSG00000024906
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133436 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118580 Gene: ENSMUSG00000024906
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140365 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146661 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167371 AA Change: Y370N PolyPhen 2 Score 0.206 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129746 Gene: ENSMUSG00000024909 AA Change: Y370N
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000165485 AA Change: Y411N PolyPhen 2 Score 0.568 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133016 Gene: ENSMUSG00000024909 AA Change: Y411N
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154215 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151932 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149908 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000166558 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147961 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168330 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167855 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132194 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000166253 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127312 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164388 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131979 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167304 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129982 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164204 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128414 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167827 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127478 Gene: ENSMUSG00000024909
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000169943 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126477 Gene: ENSMUSG00000024909
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Meta Mutation Damage Score | 0.5094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (33/33) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] A large number of extracellular matrix proteins have been found to contain variations of the epidermal growth factor (EGF) domain and have been implicated in functions as diverse as blood coagulation, activation of complement and determination of cell fate during development. The protein encoded by this gene contains four EGF2 domains and six calcium-binding EGF2 domains. This gene is necessary for elastic fiber formation and connective tissue development. Defects in this gene are cause of an autosomal recessive cutis laxa syndrome. Alternatively spliced transcript variants have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011] PHENOTYPE: Homozygous mutation of this gene results in perinatal lethality with abnormal artery and lung morphology and defects in vascular, pulmonary, and hypodermal elastic fibers. Some alleles of Mus81 also affect expression of this gene. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Efemp2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TCTACAGGTTAGAGCCAGGG -3' (R):5'- TTTAAGCAGAACGGTCATCCCTAG -3' Sequencing Primer (F):5'- ACTTGAGCAGGGGCCTTGTC -3' (R):5'- GGTCATCCCTAGGCCCC -3' |
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Posted On | 2015-06-24 |