ID | 324330 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ogfod2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1300006G11Rik, 5730405M13Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041667-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.118) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4346 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 124250384-124253544 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 124251357 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Cysteine at position 57 (Y57C) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000143318 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000024470] [ENSMUST00000031351] [ENSMUST00000119269] [ENSMUST00000122394] [ENSMUST00000198770] [ENSMUST00000196627] [ENSMUST00000198505] [ENSMUST00000145667] [ENSMUST00000196401] [ENSMUST00000149835] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9CQ04 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000024470 AA Change: Y88C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000024470 Gene: ENSMUSG00000023707 AA Change: Y88C
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031351 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031351 Gene: ENSMUSG00000029404
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000119269 AA Change: Y88C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112701 Gene: ENSMUSG00000023707 AA Change: Y88C
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122394 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112506 Gene: ENSMUSG00000029404
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127989 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130140 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131094 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148365 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000198770 AA Change: Y57C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143318 Gene: ENSMUSG00000023707 AA Change: Y57C
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000196627 AA Change: Y88C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143698 Gene: ENSMUSG00000023707 AA Change: Y88C
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000198505 AA Change: T82A |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142965 Gene: ENSMUSG00000023707 AA Change: T82A
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000199457 AA Change: Y87C |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143062 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136955 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000145667 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122377 Gene: ENSMUSG00000029404
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000196401 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142496 Gene: ENSMUSG00000029404
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149835 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116269 Gene: ENSMUSG00000029404
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Meta Mutation Damage Score | 0.8351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (31/31) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ogfod2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TCCAGCCTAGGTTACACTTCAC -3' (R):5'- AGAAGGCCCTCAAGATCTGC -3' Sequencing Primer (F):5'- AGCCTAGGTTACACTTCACTTTGG -3' (R):5'- GGACGTACTATATTCAGCTGCAGC -3' |
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Posted On | 2015-06-24 |