ID | 333895 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syt8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031098 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | synaptotagmin VIII | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.066) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4549 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 141988587-141994133 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 141993199 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Leucine at position 35 (V35L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000147572 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000097939] [ENSMUST00000105971] [ENSMUST00000105973] [ENSMUST00000105976] [ENSMUST00000105977] [ENSMUST00000118276] [ENSMUST00000122393] [ENSMUST00000210746] [ENSMUST00000210239] [ENSMUST00000145287] [ENSMUST00000149529] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9R0N6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000097939 AA Change: V213L PolyPhen 2 Score 0.034 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.82) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000095552 Gene: ENSMUSG00000031098 AA Change: V213L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105971 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101591 Gene: ENSMUSG00000031097
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105973 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101593 Gene: ENSMUSG00000031097
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105976 AA Change: V213L PolyPhen 2 Score 0.034 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.82) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101596 Gene: ENSMUSG00000031098 AA Change: V213L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105977 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101597 Gene: ENSMUSG00000031098
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000118276 AA Change: V219L PolyPhen 2 Score 0.034 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.82) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113545 Gene: ENSMUSG00000031098 AA Change: V219L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122393 AA Change: V219L PolyPhen 2 Score 0.034 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.82) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112689 Gene: ENSMUSG00000031098 AA Change: V219L
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150192 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000210746 AA Change: V35L PolyPhen 2 Score 0.128 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148896 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131034 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000211192 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145964 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128481 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000124963 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000210239 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129618 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000145287 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121819 Gene: ENSMUSG00000031097
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149529 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122733 Gene: ENSMUSG00000031097
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the synaptotagmin protein family. Synaptotagmins are membrane proteins that are important in neurotransmission and hormone secretion, both of which involve regulated exocytosis. Expression of the encoded protein in human pancreatic islets has been connected to activity of the promoter for the insulin gene, on the same chromosome several hundred kilobases away (PMID: 21336277 and 22928559). This association would link response to gluclose to insulin secretion. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2014] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Syt8 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AAGAGACATGCTGCTTTCTGG -3' (R):5'- CAGGCTATGGGCAACAAGAC -3' Sequencing Primer (F):5'- AGAGACATGCTGCTTTCTGGTAAGTC -3' (R):5'- CAAGACGGGGCTGCAACTG -3' |
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Posted On | 2015-08-18 |