ID | 4227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vdac2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | voltage-dependent anion channel 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Vdac6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.433) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 21881629-21895947 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 21888511 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glycine to Serine at position 138 (G138S) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000152916 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000022293] [ENSMUST00000152562] [ENSMUST00000153320] [ENSMUST00000173456] [ENSMUST00000172727] [ENSMUST00000224373] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q60930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000022293 AA Change: G138S PolyPhen 2 Score 0.020 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000022293 Gene: ENSMUSG00000021771 AA Change: G138S
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130224 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132364 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142084 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147715 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152562 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123032 Gene: ENSMUSG00000021771
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153320 AA Change: G138S PolyPhen 2 Score 0.013 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.78) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115560 Gene: ENSMUSG00000021771 AA Change: G138S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173456 AA Change: G126S PolyPhen 2 Score 0.004 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.59) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134023 Gene: ENSMUSG00000021771 AA Change: G126S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000172727 AA Change: G126S PolyPhen 2 Score 0.004 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.59) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133525 Gene: ENSMUSG00000021771 AA Change: G126S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224373 AA Change: G138S PolyPhen 2 Score 0.056 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the voltage-dependent anion channel pore-forming family of proteins that are considered the main pathway for metabolite diffusion across the mitochondrial outer membrane. The encoded protein is also thought to be involved in the mitochondrial apoptotic pathway via regulation of BCL2-antagonist/killer 1 protein activity. Pseudogenes have been identified on chromosomes 1, 2, 12 and 21, and alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Vdac2 |
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Posted On | 2012-04-20 |