ID | 527975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Doc2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000052301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | double C2, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 044767-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.075) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R6646 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225.009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 126446588-126451877 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice donor site (1 bp from exon) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 126450791 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000070119 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000050833] [ENSMUST00000064110] [ENSMUST00000106342] [ENSMUST00000106343] [ENSMUST00000137873] [ENSMUST00000139174] [ENSMUST00000147257] [ENSMUST00000141805] [ENSMUST00000206349] [ENSMUST00000152051] [ENSMUST00000206968] [ENSMUST00000205938] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q7TNF0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000050833 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000049851 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000064110 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000070119 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106342 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101949 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106343 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101950 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125624 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000137873 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119779 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139174 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117376 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176771 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205619 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147257 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123143 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141805 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118143 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206090 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206349 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153764 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205958 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152406 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152051 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123483 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154881 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206968 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205938 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (41/41) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] There are at least two protein isoforms of the Double C2 protein, namely alpha (DOC2A) and beta (DOC2B), which contain two C2-like domains. DOC2A and DOC2B are encoded by different genes; these genes are at times confused with the unrelated DAB2 gene which was initially named DOC-2. DOC2A is mainly expressed in brain and is suggested to be involved in Ca(2+)-dependent neurotransmitter release. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013] PHENOTYPE: Homozygous inactivation of this locus affects excitatory synaptic transmission, LTP, and learning/memory. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Doc2a |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AACGGCTACTCTGACCCTTATG -3' (R):5'- TCTGCCACTCACCTATGAAGTC -3' Sequencing Primer (F):5'- ACTCTGACCCTTATGTGAAGACGTG -3' (R):5'- CAATGTCGTAGTCCCAGA -3' |
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Posted On | 2018-07-24 |