ID | 588 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sh2d1b1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000102418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SH2 domain containing 1B1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Eat2a, Eat2, Sh2d1b, EAT-2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.061) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | F5426 (G1) of strain 24G1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 170104889-170114338 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 170107350 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000137069 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000179976] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000179976 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137069 Gene: ENSMUSG00000102418
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Meta Mutation Damage Score | 0.9755 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Het Detection Efficiency | 35.2% | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Validation Efficiency | 91% (29/32) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] By binding phosphotyrosines through its free SRC (MIM 190090) homology-2 (SH2) domain, EAT2 regulates signal transduction through receptors expressed on the surface of antigen-presenting cells (Morra et al., 2001 [PubMed 11689425]).[supplied by OMIM, Mar 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit NK cells with enhanced cytolytic capacity and an increased IFN-gamma secretion. Mice homozygous for a different knock-out allele exhibit impaired NK cell cytolysis. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Sh2d1b1 |
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Nature of Mutation | DNA sequencing using the SOLiD technique identified a C to A transversion at base pair 172209912 in the Genbank genomic region NC_000067 for the Sh2d1b1 gene on chromosome 1 (TCCCCAACAG ->TCCCCAAAAG). The mutation is located within intron 1 from the ATG exon, three nucleotides to the next exon. The Sh2d1b1 gene contains 4 total exons using Genbank record NM_012009.4 . The mutation has been confirmed by DNA sequencing using the Sanger method (Figure 1). |
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Protein Function and Prediction | The Sh2d1b1 gene encodes a 132 amino acid protein that plays a role in controlling signal transduction through at least four receptors, CD84, SLAMF1, LY9 and CD244, expressed on the surface of professional antigen-presenting cells. The protein binds to phosphorylated receptors and contains an SH2 domain at residues 5-101 (Uniprot O35324). Mice homozygous for a knock-out allele exhibit natural killer (NK) cells with enhanced cytolytic capacity and an increased IFN-gamma secretion. Mice homozygous for a different knock-out allele exhibit impaired NK cell cytolysis. |
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Posted On | 2011-03-08 |