ID | 62110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cfb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000090231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | complement factor B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FB, alternative-complement pathway C3/C5 convertase, B, Factor B, Bf, H2-Bf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038853-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0668 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 35075350-35081492 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 35076079 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glutamine to Lysine at position 1176 (Q1176K) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000117677 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000025229] [ENSMUST00000097343] [ENSMUST00000128767] [ENSMUST00000146299] [ENSMUST00000153400] [ENSMUST00000176203] [ENSMUST00000154526] [ENSMUST00000165953] [ENSMUST00000173065] [ENSMUST00000173357] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P04186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000025229 AA Change: Q663K PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000025229 Gene: ENSMUSG00000090231 AA Change: Q663K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000097343 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000094956 Gene: ENSMUSG00000024369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128767 AA Change: Q661K PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119977 Gene: ENSMUSG00000090231 AA Change: Q661K
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000129891 AA Change: Q870K |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120864 Gene: ENSMUSG00000092511 AA Change: Q870K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133127 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118360 Gene: ENSMUSG00000090231
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000141295 AA Change: Q200K |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118945 Gene: ENSMUSG00000090231 AA Change: Q200K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000146299 AA Change: Q1176K PolyPhen 2 Score 0.287 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117677 Gene: ENSMUSG00000092511 AA Change: Q1176K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153400 AA Change: Q158K PolyPhen 2 Score 0.003 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.44) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116497 Gene: ENSMUSG00000090231 AA Change: Q158K
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000176203 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135660 Gene: ENSMUSG00000090231
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000176332 AA Change: Q195K |
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000154526 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120990 Gene: ENSMUSG00000090231
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000173775 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174888 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174075 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184774 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000165953 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131195 Gene: ENSMUSG00000024369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173065 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133934 Gene: ENSMUSG00000024369
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173357 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134272 Gene: ENSMUSG00000024369
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes complement factor B, a component of the alternative pathway of complement activation. Factor B circulates in the blood as a single chain polypeptide. Upon activation of the alternative pathway, it is cleaved by complement factor D yielding the noncatalytic chain Ba and the catalytic subunit Bb. The active subunit Bb is a serine protease which associates with C3b to form the alternative pathway C3 convertase. Bb is involved in the proliferation of preactivated B lymphocytes, while Ba inhibits their proliferation. This gene localizes to the major histocompatibility complex (MHC) class III region on chromosome 6. This cluster includes several genes involved in regulation of the immune reaction. Polymorphisms in this gene are associated with a reduced risk of age-related macular degeneration. The polyadenylation site of this gene is 421 bp from the 5' end of the gene for complement component 2. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Homozygotes for targeted null mutations lack the alternative complement pathway, and have reduced overall complement activity. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Cfb |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GGGACCACTCACTTGAATGAAGCG -3' (R):5'- TGTATCTGAGCAAGGGAAGAGCCTG -3' Sequencing Primer (F):5'- ACTTGAATGAAGCGGCTTCTC -3' (R):5'- CCTGACTCGGAAGGAGGTG -3' |
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Posted On | 2013-07-30 |