ID | 6504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gtpbp10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000040464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | GTP-binding protein 10 (putative) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4930545J22Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 5587454-5609538 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 5596372 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Methionine to Lysine at position 112 (M112K) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000086225 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000088842] [ENSMUST00000115441] [ENSMUST00000119521] [ENSMUST00000147244] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8K013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000088842 AA Change: M112K PolyPhen 2 Score 0.711 (Sensitivity: 0.86; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000086225 Gene: ENSMUSG00000040464 AA Change: M112K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115441 AA Change: M191K PolyPhen 2 Score 0.014 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.79) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000111101 Gene: ENSMUSG00000040464 AA Change: M191K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119521 AA Change: M118K PolyPhen 2 Score 0.002 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.30) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113648 Gene: ENSMUSG00000040464 AA Change: M118K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126855 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118395 Gene: ENSMUSG00000040464
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127670 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128887 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121101 Gene: ENSMUSG00000040464
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147244 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119250 Gene: ENSMUSG00000040464
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198421 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152984 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152950 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Small G proteins, such as GTPBP10, act as molecular switches that play crucial roles in the regulation of fundamental cellular processes such as protein synthesis, nuclear transport, membrane trafficking, and signal transduction (Hirano et al., 2006 [PubMed 17054726]).[supplied by OMIM, Mar 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Gtpbp10 |
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Posted On | 2012-04-20 |