ID | 6817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cers2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ceramide synthase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CerS2, Trh3, 0610013I17Rik, Lass2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.922) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 95222102-95230910 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 95227997 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Lysine to Isoleucine at position 73 (K73I) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000122672 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000015841] [ENSMUST00000015858] [ENSMUST00000107170] [ENSMUST00000107171] [ENSMUST00000129267] [ENSMUST00000139498] [ENSMUST00000139866] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q924Z4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000015841 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000015841 Gene: ENSMUSG00000015697
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000015858 AA Change: K73I PolyPhen 2 Score 0.065 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000015858 Gene: ENSMUSG00000015714 AA Change: K73I
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107170 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102788 Gene: ENSMUSG00000015697
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107171 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102789 Gene: ENSMUSG00000015697
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000124638 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129267 AA Change: K73I PolyPhen 2 Score 0.242 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121110 Gene: ENSMUSG00000015714 AA Change: K73I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133748 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139498 AA Change: K73I PolyPhen 2 Score 0.373 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122672 Gene: ENSMUSG00000015714 AA Change: K73I
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139866 AA Change: K73I PolyPhen 2 Score 0.065 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120190 Gene: ENSMUSG00000015714 AA Change: K73I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156850 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142398 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134702 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154055 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a protein that has sequence similarity to yeast longevity assurance gene 1. Mutation or overexpression of the related gene in yeast has been shown to alter yeast lifespan. The human protein may play a role in the regulation of cell growth. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a gene trapped allele exhibit abnormal ceramide species and myelin sheath defects and develop hepatocellular carcinoma. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Cers2 |
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Posted On | 2012-04-20 |