ID | 696597 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atat1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024426 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | alpha tubulin acetyltransferase 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3110080J08Rik, 2610110G12Rik, MEC-17, 0610011P08Rik, 2610008K08Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 068977-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.242) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R9174 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225.009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 36208487-36220967 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 36220032 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Lysine to Arginine at position 90 (K90R) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000056383 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000025305] [ENSMUST00000056034] [ENSMUST00000061052] [ENSMUST00000077494] [ENSMUST00000113782] [ENSMUST00000141132] [ENSMUST00000141662] [ENSMUST00000149277] [ENSMUST00000174807] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8K341 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000025305 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000025305 Gene: ENSMUSG00000024436
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000056034 AA Change: K90R PolyPhen 2 Score 0.890 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000053853 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K90R
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000061052 AA Change: K90R PolyPhen 2 Score 0.261 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000056383 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K90R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000077494 AA Change: K90R PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000076703 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K90R
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000113782 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109412 Gene: ENSMUSG00000024436
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126744 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122211 Gene: ENSMUSG00000024426
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000137182 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000140292 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119039 Gene: ENSMUSG00000024426
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141132 AA Change: K47R PolyPhen 2 Score 0.261 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117824 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K47R
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000141662 AA Change: K90R PolyPhen 2 Score 0.957 (Sensitivity: 0.78; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115004 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K90R
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000149277 AA Change: K90R PolyPhen 2 Score 0.616 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122715 Gene: ENSMUSG00000024426 AA Change: K90R
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000172642 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174349 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174807 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133584 Gene: ENSMUSG00000024436
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (33/33) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a protein that localizes to clathrin-coated pits, where it acetylates alpha tubulin on lysine 40. This process may be important in microtubule growth, for instance during chemotaxis and the formation of cilium. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2016] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit impaired alpha tubulin acetylation and abnormal dentate gyrus morphology. Mice homozygous for a different knock-out allele exhibit reduced male fertility associated with teratozoospermia, oligozoospermia andasthenozoospermia. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Atat1 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGAATGCAAAGGGGTTCTACCTC -3' (R):5'- TCACCAGCGCTTTGAGGATG -3' Sequencing Primer (F):5'- CCGGTCATCCTAAGAGGTCAAG -3' (R):5'- GATGCAAAGCAACCGGC -3' |
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Posted On | 2022-02-07 |