ID | 7628 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Casp6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027997 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | caspase 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Mch2, mCASP-6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038262-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.422) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | P0005 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 129695074-129707752 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 129705792 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Alanine at position 153 (V153A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000029626 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029624] [ENSMUST00000029626] [ENSMUST00000153506] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | O08738 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029624 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029624 Gene: ENSMUSG00000027994
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029626 AA Change: V153A PolyPhen 2 Score 0.406 (Sensitivity: 0.89; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029626 Gene: ENSMUSG00000027997 AA Change: V153A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137314 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000146340 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115224 Gene: ENSMUSG00000027994
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152622 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153506 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118170 Gene: ENSMUSG00000027994
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Meta Mutation Damage Score | 0.1283 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 95% (104/109) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: This gene encodes a member of the cysteine proteases that plays important roles in regulating apoptosis and neurodegeneration. The encoded protein is involved in the transmission of pain and axonal degeneration. Genetic deletion of this gene in mice results in the delay of axon pruning and protects from axon degeneration. [provided by RefSeq, Apr 2015] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit failure to induce increased lysis of fluorogenic substrate VEID-AMC in staurosporine treated of lenses. Mice homozygous for a different knock-out allele exhibit resistance to excitotoxicity and axonal degeneration. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Casp6 |
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Protein Function and Prediction | Casp6 or MCH2 is a ced-3 apoptotic protease that is highly homologous to human CASP3 [OMIM #601532; (1)]. Casp6 functions downstream of the cell death inhibitors Bcl2 and BclXL (2). Casp6 is required for axonal degeneration (3;4). Casp6 was characterized as an effector caspase essential for the maturation of proinflammatory cytokines and lymphocyte development (5). Casp6 cleaves substrates involved in cell cycle, survival, or development (5). It has been proposed that Casp6 dysregulation is involved in the pathogenesis of gastrointestinal cancers, invasive melanomas, and other metastatic cancers [(6-8); reviewed in (5)]. |
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Expression/Localization | Northern blot analysis identified a 1262 bp transcript found in all tissues with predominant expression in liver, lung, kidney, testis, and heart (1). |
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Background | KO information: Casp6tm1.2Xen; MGI:5426933 Genetic background: FVB.B6NTac-Casp6tm1.2Xen At 3 months, mice exhibit normal cortex volume, striatal volume, neuronal striatal counts, brain weight and cerebellum weight (4). However, at 8 months, they exhibit increased striatal and cortical volume, although the brain and cerebellum weight remains equivalent to wild-type (4). In the knockout animals, septal cholinergic neurons are protected from myelin-induced degeneration compared with wild-type cells and medium spiny neurons are protected from NMDA-mediated excitotoxicity compared with wild-type cells.
Casp6tm1Flv; MGI: 3603318 Genetic background not specified In this model, the lenses appear grossly normal, althoughstaurosporine treatment of lenses fails to induce increased lysis of fluorogenic substrate VEID-AMC as it does in wild-type lenses (9). Also, thymocytes treated with dexamthasone display normal phosphatidyl serine flip-flop (10). |
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References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Posted On | 2012-10-05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Science Writer | Anne Murray |