ID | 98045 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Srsf2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034120 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | serine and arginine-rich splicing factor 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sfrs2, MRF-1, Sfrs10, D11Wsu175e, SC35 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039203-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1130 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 116740727-116743920 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | unclassified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 116743009 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000021173] [ENSMUST00000092404] [ENSMUST00000106363] [ENSMUST00000106365] [ENSMUST00000106370] [ENSMUST00000136914] [ENSMUST00000153084] [ENSMUST00000143184] [ENSMUST00000136012] [ENSMUST00000139954] [ENSMUST00000190993] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q62093 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000021173 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000021173 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000092404 AA Change: S171P |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000090059 Gene: ENSMUSG00000034120 AA Change: S171P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106363 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101971 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106365 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101973 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106370 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101978 Gene: ENSMUSG00000090266
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125920 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126661 |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000136914 AA Change: S171P |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120086 Gene: ENSMUSG00000034120 AA Change: S171P
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000138484 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151944 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000175930 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176799 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135135 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177429 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000132593 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153084 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123368 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176834 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000143184 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119131 Gene: ENSMUSG00000090266
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000140869 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000136012 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118203 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139954 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118112 Gene: ENSMUSG00000020818
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000190993 AA Change: S171P |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140016 Gene: ENSMUSG00000034120 AA Change: S171P
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: The protein encoded by this gene is a member of the serine/arginine (SR)-rich family of pre-mRNA splicing factors, which constitute part of the spliceosome. Each of these factors contains an RNA recognition motif (RRM) for binding RNA and an RS domain for binding other proteins. The RS domain is rich in serine and arginine residues and facilitates interaction between different SR splicing factors. In addition to being critical for mRNA splicing, the SR proteins have also been shown to be involved in mRNA export from the nucleus and in translation. [provided by RefSeq, Sep 2010] PHENOTYPE: Homozygous mutants are embryonic lethal. Deaths occur prior to E7.5. Cre induced inactivation of this pre-mRNA splicing factor in the thymus impairs T-cell maturation. Inactivation in ventricular cardiomyocytes results in dilated cardiomyopathy without gross changes in cardiomyocyte development. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Srsf2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GTCTCAGATTCCCGCAGACATTACC -3' (R):5'- CTTCGTCCGGTTCCACGACAAG -3' Sequencing Primer (F):5'- CCGCAGACATTACCATTTTCTTAG -3' (R):5'- CAGATAATggcggcgggg -3' |
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Posted On | 2014-01-05 |