Allele | sposh | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mutation Type | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinate | 104,059,150 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Base Change | A ⇒ G (forward strand) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene | Ednrb | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | endothelin receptor type B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonym(s) | ETR-b, Sox10m1, ETb | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 104,052,061-104,081,838 bp (-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: This gene encodes a member of the G-protein coupled receptor family. It encodes a receptor for endothelins, peptides that are involved in vasocontriction. The encoded protein activates a phosphatidylinositol-calcium second messenger system and is required for the development of enteric neurons and melanocytes. Gene disruption causes pigmentation anomalies, deafness, and abnormal dilation of the colon due to defects of neural crest-derived cells. Mutations in this gene are found in the piebald mouse, and mouse models of Hirschsprung's disease and Waardenburg syndrome type 4. Renal collecting duct-specific gene deletion causes sodium retention and hypertension. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013] PHENOTYPE: Mice homozygous for null mutations have pigmentation limited to small patches on the head and rump and die from megacolon resulting from impaired neural crest migration and aganglionosis. Heterozygotes for a null allele show improved cardiac tolerance to hypoxia. [provided by MGI curators] |
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Accession Number | NCBI RefSeq: NM_007904.4, NM_001276296.1, NM_001136061.2; MGI: 102720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Phenylalanine changed to Serine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for protein(s): [ENSMUSP00000022718] [ENSMUSP00000126057] [ENSMUSP00000154806] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P48302 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000022718 Gene: ENSMUSG00000022122 AA Change: F292S
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Predicted Effect | probably damaging
PolyPhen 2 Score 0.974 (Sensitivity: 0.76; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126057 Gene: ENSMUSG00000022122 AA Change: F292S
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Predicted Effect | probably damaging
PolyPhen 2 Score 0.974 (Sensitivity: 0.76; Specificity: 0.96) |
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Predicted Effect | probably damaging
PolyPhen 2 Score 0.974 (Sensitivity: 0.76; Specificity: 0.96) |
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Meta Mutation Damage Score | 0.7425 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Is this an essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.716) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenotypic Category | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Candidate Explorer Status | loading ... | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Single pedigree Linkage Analysis Data |
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Penetrance | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles Listed at MGI | All mutations/alleles(48) : Chemically and radiation induced(2) Chemically induced (ENU)(2) Chemically induced (other)(11) Radiation induced(18) Spontaneous(4) Targeted(11) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lab Alleles |
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Mode of Inheritance | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Local Stock | Live Mice | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repository | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Updated | 2019-09-04 9:38 PM by Anne Murray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Record Created | 2018-01-30 2:48 PM by Jamie Russell | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Record Posted | 2018-03-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenotypic Description |
The sposh phenotype was identified among N-ethyl-N-nitrosourea (ENU)-induced G3 mice of the pedigree R5802, some of which showed variable white belly spotting (Figure 1). |
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Nature of Mutation |
Whole exome HiSeq sequencing of the G1 grandsire identified 63 mutations. The pigmentation phenotype was linked to a mutation in Ednrb: a T to C transition at base pair 103,821,714 (v38) on chromosome 14, or base pair 22,763 in the GenBank genomic region NC_000080 encoding Ednrb. Linkage was found with a recessive model of inheritance (P = 0.000234), wherein six affected mice were homozygous (N = 5) or heterozygous (N = 1) for the variant allele, and 31 unaffected mice were either heterozygous (N = 22) or homozygous for the reference allele (N = 9) (Figure 2). The mutation corresponds to residue 1,286 in the mRNA sequence NM_001136061.2 within exon 5 of 8 total exons.
The mutated nucleotide is indicated in red. The mutation results in a phenylalanine to serine substitution at amino acid 292 (F292S) in both endothelin receptor type B (ETBR) isoforms. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Illustration of Mutations in Gene & Protein |
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Protein Prediction |
Ednrb encodes endothelin receptor type B (ETBR), a member of the endothelin (ET) receptor family of rhodopsin-like G protein-coupled receptors (GPCRs; see the record for Bemr3) (1;2). The rhodopsin-like GPCRs have seven helical transmembrane domains, three extracellular and three intracellular loops, an extracellular N-terminus, and a cytoplasmic C-terminus (Figure 3). The sposh mutation results in a phenylalanine to serine substitution at amino acid 292 in both endothelin receptor type B (ETBR) isoforms; amino acid 292 is within the fifth transmembrane domain. Please see the record gus-gus for more information on Ednrb.
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Putative Mechanism | ET-associated signaling (ET-1/ETAR and ET-3/ETBR) is essential for neural crest (NC) cell proliferation, migration, differentiation, and transformation (3-5). The embryonic NC gives rise to pluripotent cells that migrate to different locations within the embryo during development (6). The NC cells subsequently differentiate into several cell types including adrenomedullary cells, craniofacial skeletal tissue, glia and some neurons of the peripheral nervous system, enteric neurons and glia, and melanocytes of the skin, hair and inner ear. ET-3/ETBR-associated signaling is required between embryonic day (E)10-E12.5 in the mouse for the survival and migration of enteric ganglion neurons and melanocytes derived from trunk/vagal NC cells (4;5;7-11). Other studies indicate that ETBR signaling may also stimulate melanocyte proliferation in the epidermis (11). Mice homozygous for targeted as well as naturally occurring Ednrb null mutations (e.g., MGI:1856148, MGI:1856149, MGI:1857161, and MGI:3795226) exhibit a piebald appearance due to the absence of NC-derived melanocytes in the epidermis (7;9;12-14). Ednrb null mice also exhibit an absence of choroidal melanocytes; neuroectoderm-derived pigment epithelium melanocytes develop normally (7). Ednrb null mice display early postnatal lethality [from ~postnatal day 15 to up to seven weeks after birth; (7;12;14)]. The sposh mice exhibit variable white belly spotting. The Ednrb knockout mouse models have established that the observed pigmentation defects are due to the absence of NC-derived melanocytes in the hair bulbs of non-pigmented areas (7;9;12-14). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primers |
PCR Primer sposh_pcr_F: CCTAGGCTAATCGAGATTCCATC sposh_pcr_R: GTAGATATGGCCCACGAAACC Sequencing Primer sposh_seq_F: GCTAATCGAGATTCCATCTTAAAAGG sposh_seq_R: TAGATATGGCCCACGAAACCCTATAC |
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Genotyping | PCR program 1) 94°C 2:00 The following sequence of 564 nucleotides is amplified (chromosome 14, - strand): 1 gtagatatgg cccacgaaac cctatacagt acatatatgg aagatgttac aaaataattg Primer binding sites are underlined and the sequencing primers are highlighted; the mutated nucleotide is shown in red. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Science Writers | Anne Murray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Illustrators | Diantha La Vine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Authors | Lauren Prince, Jamie Russell, and Bruce Beutler |