ID | 566 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Frrs1l | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000045589 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ferric-chelate reductase 1 like | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6430704M03Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.425) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | F5493 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 56960136-56990391 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 56968293 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Methionine to Valine at position 160 (M160V) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000052507 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000053681] [ENSMUST00000128276] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | B1AXV0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000053681 AA Change: M160V PolyPhen 2 Score 0.130 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000052507 Gene: ENSMUSG00000045589 AA Change: M160V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128276 |
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Meta Mutation Damage Score | 0.2123 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Het Detection Efficiency | 27.8% | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Validation Efficiency | 67% (74/111) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a component of the outer-core of an alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) receptor protein in the brain. The encoded protein is thought to interact with inner-core components of the receptor, and play a role in the modulation of glutamate signaling. Mutations in this gene are associated with early infantile epileptic encephalopathy 37. [provided by RefSeq, Jul 2016] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Frrs1l |
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Nature of Mutation | DNA sequencing using the SOLiD technique identified an A to G transition at position 598 of the 6430704M03Riktranscript in exon 4 of 5 total exons. Multiple transcripts of the 6430704M03Rikgene are displayed on Ensembl and Vega. The mutated nucleotide causes a methionine to valine substitution at amino acid 160 of the encoded protein. The mutation has been confirmed by DNA sequencing using the Sanger method (see related file). |
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Protein Function and Prediction | The 6430704M03Rik gene is predicted to encode a 293 amino acid protein. SMART analysis indicates a signal peptide at amino acids 1-28 and a DoH or DOMON domain at amino acids 118-261. This predominantly beta-sheet domain is typically found in as a regulatory N-terminal domain in dopamine beta-monooxygenase and and in several other secreted and transmembrane proteins. A C-terminal transmembrane domain is located at residues 267-289. The M160V change is located in the DoH domain, and is predicted to be possibly damaging by the PolyPhen program. |
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Posted On | 2010-11-29 |