ID | 100709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | H2-T13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histocompatibility 2, T region locus 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | blastocyst MHC, H-2T13, H2-Bl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039280-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Not available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1211 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 36391007-36395115 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 36391965 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Aspartic acid at position 207 (V207D) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000141271 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000173080] [ENSMUST00000183560] [ENSMUST00000183999] [ENSMUST00000184502] [ENSMUST00000185087] [ENSMUST00000194244] [ENSMUST00000195833] [ENSMUST00000192532] [ENSMUST00000195838] [ENSMUST00000185167] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000173080 AA Change: V310D PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134155 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V310D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000174067 AA Change: V218D PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133982 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V218D
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000183560 AA Change: V36D PolyPhen 2 Score 0.915 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138812 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V36D
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000183999 AA Change: V50D PolyPhen 2 Score 0.915 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139165 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V50D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000184502 AA Change: V218D PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139275 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V218D
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184850 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000185087 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139166 Gene: ENSMUSG00000073406
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000194244 AA Change: V218D PolyPhen 2 Score 0.972 (Sensitivity: 0.77; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141809 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V218D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000195833 AA Change: V207D PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141271 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V207D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000192532 AA Change: V300D PolyPhen 2 Score 0.990 (Sensitivity: 0.72; Specificity: 0.97) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142113 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V300D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000195838 AA Change: V299D PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141253 Gene: ENSMUSG00000073406 AA Change: V299D
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000185167 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139373 Gene: ENSMUSG00000073406
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in H2-T13 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGTTCCCAGAACTGACAGAGGACC -3' (R):5'- TCACCCTGACCTGGCAGTTGAATG -3' Sequencing Primer (F):5'- CTGACAGAGGACCCAGGTG -3' (R):5'- ACATGCCATGTGTACCATGAG -3' |
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Posted On | 2014-01-15 |