ID | 257062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tox4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000016831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TOX high mobility group box family member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5730589K01Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2980 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 52516603-52532966 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 52529983 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Serine to Proline at position 548 (S548P) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000022766 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000022766] [ENSMUST00000022767] [ENSMUST00000122962] [ENSMUST00000147768] [ENSMUST00000174351] [ENSMUST00000173896] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8BU11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000022766 AA Change: S548P PolyPhen 2 Score 0.004 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.59) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000022766 Gene: ENSMUSG00000016831 AA Change: S548P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000022767 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000022767 Gene: ENSMUSG00000022160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122962 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127797 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130550 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147768 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134577 Gene: ENSMUSG00000022160
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152493 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000173546 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156611 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174351 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134732 Gene: ENSMUSG00000022160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173656 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133759 Gene: ENSMUSG00000022160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173896 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133506 Gene: ENSMUSG00000022160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174360 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134578 Gene: ENSMUSG00000022160
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tox4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTCCTGAGACAATCTGTGAAATG -3' (R):5'- CTGTTAAACTCACCTGCAGTGC -3' Sequencing Primer (F):5'- CCTGAGACAATCTGTGAAATGATCGC -3' (R):5'- GTTAAACTCACCTGCAGTGCTTCAC -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |