ID | 7773 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tmub1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028958 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010004O20Rik, Hops | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038271-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.102) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | P0018 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 24650456-24652852 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 24651755 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Alanine to Serine at position 55 (A55S) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000122487 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000030799] [ENSMUST00000030800] [ENSMUST00000115033] [ENSMUST00000115036] [ENSMUST00000115041] [ENSMUST00000115043] [ENSMUST00000123167] [ENSMUST00000127194] [ENSMUST00000144389] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JMG3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000030799 AA Change: A55S PolyPhen 2 Score 0.528 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030799 Gene: ENSMUSG00000028958 AA Change: A55S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000030800 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030800 Gene: ENSMUSG00000028959
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000115033 AA Change: A55S PolyPhen 2 Score 0.528 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110685 Gene: ENSMUSG00000028958 AA Change: A55S
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000115036 AA Change: A70S PolyPhen 2 Score 0.615 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110688 Gene: ENSMUSG00000028958 AA Change: A70S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115041 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110693 Gene: ENSMUSG00000028959
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115043 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110695 Gene: ENSMUSG00000028959
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000123144 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000123167 AA Change: A55S PolyPhen 2 Score 0.831 (Sensitivity: 0.84; Specificity: 0.93) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122487 Gene: ENSMUSG00000028958 AA Change: A55S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127194 AA Change: A55S PolyPhen 2 Score 0.130 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123173 Gene: ENSMUSG00000028958 AA Change: A55S
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000193014 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149085 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000195796 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134958 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144866 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130577 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149537 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131946 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132109 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132498 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000139307 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144389 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198276 |
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Meta Mutation Damage Score | 0.0745 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 72% (76/106) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Knockout mice exhibit a strong increase in home cage locomotor activity during the dark phase (subjective day) of the light:dark (L:D) cycle, and increased waking and decreased NREM & REM times during the dark phase as determined by EEG analysis. Decreased abdominal fat and monocyte counts are seen. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tmub1 |
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Posted On | 2012-10-29 |