ID | 860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Alg3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D16Ertd36e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.260) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 20424208-20429515 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 20426608 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Alanine at position 211 (V211A) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000156072 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000045918] [ENSMUST00000079600] [ENSMUST00000096197] [ENSMUST00000115522] [ENSMUST00000119224] [ENSMUST00000147867] [ENSMUST00000123774] [ENSMUST00000231531] [ENSMUST00000231386] [ENSMUST00000232319] [ENSMUST00000120394] [ENSMUST00000231904] [ENSMUST00000231749] [ENSMUST00000231362] [ENSMUST00000231471] [ENSMUST00000231387] [ENSMUST00000159780] [ENSMUST00000232458] [ENSMUST00000232451] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8K2A8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000045918 AA Change: V211A PolyPhen 2 Score 0.746 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000045272 Gene: ENSMUSG00000033809 AA Change: V211A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000046188 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000079600 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000078550 Gene: ENSMUSG00000115293
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000096197 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000093911 Gene: ENSMUSG00000046613
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115522 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000111184 Gene: ENSMUSG00000115219
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000117019 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113772 Gene: ENSMUSG00000115219
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000127454 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120559 Gene: ENSMUSG00000033809
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147867 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123774 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123378 Gene: ENSMUSG00000033809
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000231531 AA Change: V89A PolyPhen 2 Score 0.746 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000231386 AA Change: V211A PolyPhen 2 Score 0.963 (Sensitivity: 0.78; Specificity: 0.95) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000232319 AA Change: V89A PolyPhen 2 Score 0.886 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120394 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113475 Gene: ENSMUSG00000115293
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231904 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231749 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231362 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000231608 |
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000231471 |
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000231387 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159780 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123727 Gene: ENSMUSG00000046613
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000232458 AA Change: V137A PolyPhen 2 Score 0.746 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000232451 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the ALG3 family. The encoded protein catalyses the addition of the first dol-P-Man derived mannose in an alpha 1,3 linkage to Man5GlcNAc2-PP-Dol. Defects in this gene have been associated with congenital disorder of glycosylation type Id (CDG-Id) characterized by abnormal N-glycosylation. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Alg3 |
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Posted On | 2011-07-12 |