ID | 27099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tpd52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor protein D52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mD52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.089) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 8991590-9069824 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 9012692 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000123147 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000063496] [ENSMUST00000063496] [ENSMUST00000091354] [ENSMUST00000091354] [ENSMUST00000091355] [ENSMUST00000091355] [ENSMUST00000094381] [ENSMUST00000094381] [ENSMUST00000120143] [ENSMUST00000120143] [ENSMUST00000121038] [ENSMUST00000121038] [ENSMUST00000124956] [ENSMUST00000124956] [ENSMUST00000145905] [ENSMUST00000145905] [ENSMUST00000134788] [ENSMUST00000134788] [ENSMUST00000155450] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q62393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000063496 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000066826 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000063496 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000066826 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000091354 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088913 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000091354 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088913 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000091355 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088914 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000091355 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088914 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000094381 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000091943 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000094381 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000091943 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000120143 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112830 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000120143 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112830 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121038 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113368 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121038 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113368 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000124956 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119077 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000124956 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119077 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000145905 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123147 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000145905 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123147 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129736 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000134788 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119899 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000134788 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119899 Gene: ENSMUSG00000027506
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155450 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120317 Gene: ENSMUSG00000027506
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tpd52 |
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Posted On | 2013-04-17 |