ID | 248274 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Asb6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ankyrin repeat and SOCS box-containing 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2510004M11Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.215) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2376 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 30713109-30718312 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 30714414 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Methionine to Threonine at position 232 (M232T) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000043462 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000041726] [ENSMUST00000041830] [ENSMUST00000127566] [ENSMUST00000128303] [ENSMUST00000129628] [ENSMUST00000129712] [ENSMUST00000138889] [ENSMUST00000152374] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q91ZU1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000041726 AA Change: M232T PolyPhen 2 Score 0.081 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.85) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000043462 Gene: ENSMUSG00000039483 AA Change: M232T
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000041830 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000035303 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127566 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142189 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128303 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123140 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129628 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129712 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141222 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000138889 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141905 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147414 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144330 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148036 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152374 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116760 Gene: ENSMUSG00000026857
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000143970 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene belongs to a family of ankyrin repeat proteins that, along with four other protein families, contain a C-terminal SOCS box motif. Growing evidence suggests that the SOCS box, similar to the F-box, acts as a bridge between specific substrate-binding domains and the more generic proteins that comprise a large family of E3 ubiquitin protein ligases. Alternatively spliced transcript variants have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Asb6 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GTTGAAGCCAGACCAACAGG -3' (R):5'- CCTGTCTGTCCATAGCTGTG -3' Sequencing Primer (F):5'- AACAGGATGCACCGTGC -3' (R):5'- TGGGGACACTGTATTCAC -3' |
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Posted On | 2014-11-11 |