ID | 386425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Doc2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000052301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | double C2, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041905-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.077) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4644 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 126446588-126451877 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 126450618 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Lysine at position 298 (T298K) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000070119 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000050833] [ENSMUST00000064110] [ENSMUST00000106342] [ENSMUST00000106343] [ENSMUST00000137873] [ENSMUST00000139174] [ENSMUST00000206968] [ENSMUST00000206349] [ENSMUST00000205938] [ENSMUST00000141805] [ENSMUST00000147257] [ENSMUST00000152051] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q7TNF0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000050833 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000049851 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000064110 AA Change: T298K PolyPhen 2 Score 0.024 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.81) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000070119 Gene: ENSMUSG00000052301 AA Change: T298K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106342 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101949 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106343 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101950 Gene: ENSMUSG00000030689
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125624 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000137873 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119779 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139174 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117376 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205619 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154881 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206968 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205958 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153764 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206349 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152406 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205938 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206090 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176771 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141805 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118143 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147257 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123143 Gene: ENSMUSG00000052301
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152051 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123483 Gene: ENSMUSG00000052301
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Meta Mutation Damage Score | 0.4225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 98% (44/45) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] There are at least two protein isoforms of the Double C2 protein, namely alpha (DOC2A) and beta (DOC2B), which contain two C2-like domains. DOC2A and DOC2B are encoded by different genes; these genes are at times confused with the unrelated DAB2 gene which was initially named DOC-2. DOC2A is mainly expressed in brain and is suggested to be involved in Ca(2+)-dependent neurotransmitter release. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013] PHENOTYPE: Homozygous inactivation of this locus affects excitatory synaptic transmission, LTP, and learning/memory. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Doc2a |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGAGCCTGTAGACTCACCTC -3' (R):5'- TTTCTGTGAGGCCTAACCAC -3' Sequencing Primer (F):5'- GTAGACTCACCTCTGCCCC -3' (R):5'- TGAGGCCTAACCACATCGCTG -3' |
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Posted On | 2016-05-26 |