ID | 63536 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Glmp | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glycosylated lysosomal membrane protein | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610031J06Rik, NCU-G1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038903-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0721 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 88232330-88235938 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | nonsense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 88233452 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glutamic Acid to Stop codon at position 136 (E136*) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000135398 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000001452] [ENSMUST00000001454] [ENSMUST00000001456] [ENSMUST00000107552] [ENSMUST00000107553] [ENSMUST00000131666] [ENSMUST00000177005] [ENSMUST00000176425] [ENSMUST00000164166] [ENSMUST00000154381] [ENSMUST00000176519] [ENSMUST00000168062] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JHJ3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000001452 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001452 Gene: ENSMUSG00000001416
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000001454 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001454 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000001456 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001456 Gene: ENSMUSG00000001420
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107552 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103176 Gene: ENSMUSG00000001420
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107553 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103177 Gene: ENSMUSG00000001420
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131666 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120235 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140039 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000177005 AA Change: E136* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135398 Gene: ENSMUSG00000001418 AA Change: E136*
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000176425 AA Change: E51* |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135575 Gene: ENSMUSG00000001418 AA Change: E51*
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000167718 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000193646 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152801 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153716 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000167000 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000164122 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164166 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126109 Gene: ENSMUSG00000001416
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154381 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134809 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176519 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135263 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168971 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131250 Gene: ENSMUSG00000001416
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168062 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131113 Gene: ENSMUSG00000001416
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Homozygous mutants for this allele displayed spontaneous development of liver fibrosis at 6 months and various hepatic cell phenotypes. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Glmp |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TCCCCAAGAGCAGCATACAGTTTTC -3' (R):5'- AGCTTGAGGGACAGATACTCCCAC -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGCAGCATACAGTTTTCTTCTG -3' (R):5'- ACCCTCATCAGTCATTTCCAG -3' |
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Posted On | 2013-07-30 |