ID | 88876 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pcbp4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023495 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | poly(rC) binding protein 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AlphaCP-4, 1200003L19Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.182) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01484 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 106330490-106341211 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice acceptor site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 106337848 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000150869 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000024260] [ENSMUST00000164834] [ENSMUST00000185507] [ENSMUST00000185779] [ENSMUST00000185874] [ENSMUST00000190430] [ENSMUST00000213156] [ENSMUST00000214252] [ENSMUST00000215656] [ENSMUST00000190428] [ENSMUST00000189099] [ENSMUST00000188396] [ENSMUST00000216379] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000024260 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000024260 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164834 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129055 Gene: ENSMUSG00000091735
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000185507 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140660 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000185779 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140629 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000185831 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000185854 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000185874 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141057 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000190430 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140485 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000190799 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000189882 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000185996 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000188448 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000186519 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000213156 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000214252 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000215656 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000213752 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000190428 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139587 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000189099 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139991 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000213201 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000188396 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139771 Gene: ENSMUSG00000023495
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000217405 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000216379 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the KH-domain protein subfamily. Proteins of this subfamily, also referred to as alpha-CPs, bind to RNA with a specificity for C-rich pyrimidine regions. Alpha-CPs play important roles in post-transcriptional activities and have different cellular distributions. This gene is induced by the p53 tumor suppressor, and the encoded protein can suppress cell proliferation by inducing apoptosis and cell cycle arrest in G(2)-M. This gene's protein is found in the cytoplasm, yet it lacks the nuclear localization signals found in other subfamily members. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described, but the full-length nature for only some has been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous or heterozygous for a knock-out allele are reduced in body weight and prone to lung adenocarcinoma, B cell derived lymphoma and lung tumors. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pcbp4 |
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Posted On | 2013-11-18 |