ID | 76576 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ccdc163 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028689 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | coiled-coil domain containing 163 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4933430J04Rik, 0610037D15Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038960-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.074) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0780 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 116565537-116572881 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 116569604 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Lysine to Glutamic Acid at position 222 (K222E) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000102072 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000030452] [ENSMUST00000030453] [ENSMUST00000106462] [ENSMUST00000106463] [ENSMUST00000106464] [ENSMUST00000125671] [ENSMUST00000138305] [ENSMUST00000155391] [ENSMUST00000130828] [ENSMUST00000135499] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | A2AGD7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000030452 AA Change: K196E PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030452 Gene: ENSMUSG00000028689 AA Change: K196E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000030453 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030453 Gene: ENSMUSG00000028690
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106462 AA Change: K105E PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102070 Gene: ENSMUSG00000028689 AA Change: K105E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106463 AA Change: K222E PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102071 Gene: ENSMUSG00000028689 AA Change: K222E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106464 AA Change: K222E PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102072 Gene: ENSMUSG00000028689 AA Change: K222E
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000124628 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000125671 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120954 Gene: ENSMUSG00000028689
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126197 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129624 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143330 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134192 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000138305 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155391 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120050 Gene: ENSMUSG00000028689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130828 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120572 Gene: ENSMUSG00000028689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000135499 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114263 Gene: ENSMUSG00000028689
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000156206 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123645 Gene: ENSMUSG00000028689
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ccdc163 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CATCACCTTGGTATCTTCCCAGCAG -3' (R):5'- ACTGACCACCCTAACCAATTTTGGC -3' Sequencing Primer (F):5'- TGAAGTTGGAGAATGGTCCC -3' (R):5'- AAGGTATGAACCCTGTCCATCTG -3' |
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Posted On | 2013-10-16 |