ID | 238306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rfc4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | replication factor C (activator 1) 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A1, RFC37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040196-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.963) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2194 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 22932698-22946480 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | unclassified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | TTTGTTGTTGTTG to TTTGTTGTTG at 22932902 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000156170 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000023598] [ENSMUST00000023599] [ENSMUST00000077605] [ENSMUST00000115337] [ENSMUST00000115338] [ENSMUST00000115341] [ENSMUST00000131871] [ENSMUST00000123413] [ENSMUST00000133847] [ENSMUST00000147117] [ENSMUST00000187168] [ENSMUST00000232287] [ENSMUST00000168891] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99J62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000023598 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000023598 Gene: ENSMUSG00000022881
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000023599 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000023599 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000077605 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000090876 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082448 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082946 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083274 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115337 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110994 Gene: ENSMUSG00000022881
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115338 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110995 Gene: ENSMUSG00000022881
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134816 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130775 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142031 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135020 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130113 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130483 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125553 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125969 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140017 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115341 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110998 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131871 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118141 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123413 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115649 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133847 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115479 Gene: ENSMUSG00000022881
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156227 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000197708 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149328 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000157310 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148085 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150117 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147321 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152129 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144493 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147117 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121745 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000187168 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140809 Gene: ENSMUSG00000022884
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000232287 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168891 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127030 Gene: ENSMUSG00000022884
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The elongation of primed DNA templates by DNA polymerase delta and DNA polymerase epsilon requires the accessory proteins proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and replication factor C (RFC). RFC, also named activator 1, is a protein complex consisting of five distinct subunits of 140, 40, 38, 37, and 36 kD. This gene encodes the 37 kD subunit. This subunit forms a core complex with the 36 and 40 kDa subunits. The core complex possesses DNA-dependent ATPase activity, which was found to be stimulated by PCNA in an in vitro system. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rfc4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TAACTGGTTTCATACAAAAGGGGAG -3' (R):5'- GCACTTAACAAGGCAGAGGC -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGATGAAGCCTCTAACAGTTCTG -3' (R):5'- GGCCAGGGCAATCTGTAAC -3' |
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Posted On | 2014-10-02 |