ID | 266788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tm7sf2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transmembrane 7 superfamily member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANG1, 3110041O18Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040633-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3415 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 6112851-6117880 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 6113629 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Histidine at position 301 (Y301H) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000025713 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000025711] [ENSMUST00000025713] [ENSMUST00000043074] [ENSMUST00000113543] [ENSMUST00000159084] [ENSMUST00000159832] [ENSMUST00000161718] [ENSMUST00000162575] [ENSMUST00000162726] [ENSMUST00000160028] [ENSMUST00000161090] [ENSMUST00000162810] [ENSMUST00000161528] [ENSMUST00000178310] [ENSMUST00000179142] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q71KT5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000025711 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000025711 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000025713 AA Change: Y301H PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000025713 Gene: ENSMUSG00000024799 AA Change: Y301H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000043074 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000042835 Gene: ENSMUSG00000038274
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000113543 AA Change: Y301H PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109171 Gene: ENSMUSG00000024799 AA Change: Y301H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159084 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124868 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159475 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159832 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123994 Gene: ENSMUSG00000024797
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000161718 AA Change: Y101H PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124283 Gene: ENSMUSG00000024799 AA Change: Y101H
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159836 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162721 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160354 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160417 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160324 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162549 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161634 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162575 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125586 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162726 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134031 Gene: ENSMUSG00000075227
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160028 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124847 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161090 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125543 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162810 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124825 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161528 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123989 Gene: ENSMUSG00000024799
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000178310 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000136803 Gene: ENSMUSG00000038274
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000179142 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000136358 Gene: ENSMUSG00000038274
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a null allele exhibit normal plasma cholesterol levels. [provided by MGI curators] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tm7sf2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGTCGGGATGGTCTCAAGAC -3' (R):5'- CATCTGCCTCCTTAAGGGTC -3' Sequencing Primer (F):5'- CCTAGAAATACAGCTAATGAAACGG -3' (R):5'- ATCTGCCTCCTTAAGGGTCAGTAG -3' |
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Posted On | 2015-02-18 |