ID | 329798 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ggn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | gametogenetin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4444 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 28869635-28873363 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 28871585 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Alanine at position 322 (T322A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000146750 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000033886] [ENSMUST00000048923] [ENSMUST00000059642] [ENSMUST00000098609] [ENSMUST00000182328] [ENSMUST00000186182] [ENSMUST00000208330] [ENSMUST00000209019] [ENSMUST00000209034] [ENSMUST00000208288] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q80WJ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000033886 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000033886 Gene: ENSMUSG00000031493
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000048923 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000046216 Gene: ENSMUSG00000037239
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000059642 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000051657 Gene: ENSMUSG00000030591
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000098609 AA Change: T358A PolyPhen 2 Score 0.008 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.76) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000096209 Gene: ENSMUSG00000031493 AA Change: T358A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130390 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000182328 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138613 Gene: ENSMUSG00000030591
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000186182 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139514 Gene: ENSMUSG00000030591
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000208330 AA Change: T335A PolyPhen 2 Score 0.008 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.76) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209019 AA Change: T322A PolyPhen 2 Score 0.063 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000208659 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000207087 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000208461 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209034 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000208288 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000208592 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene is a germ cell-specific gene that encodes proteins that interact with POG (proliferation of germ cells). Alternatively spliced transcript variants of a similar mouse gene encode at least three different proteins, namely gametogenetin protein 1a, gametogenetin protein 2, and gametogenetin protein 3, which show a perinuclear, cytoplasmic, and nucleolar localization, respectively. These proteins regulate the localization of POG and may play a role in spermatogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit early embryonic lethality. Mice heterozygous for this allele exhibit impaired double-strand break repair in spermatocytes. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ggn |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AAGTCACCTTCAAGTCGGGG -3' (R):5'- CCCCATTGAATCGGAAATGC -3' Sequencing Primer (F):5'- GGTCCCTTAGCAGCCAAAG -3' (R):5'- GAAATGCCGTTCAGTGCCATCAG -3' |
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Posted On | 2015-07-21 |