ID | 330479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dclre1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA cross-link repair 1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mSNM1B, SNMIB, Apollo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041731-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4474 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 103707921-103716703 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | unclassified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 103714559 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000143355 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029435] [ENSMUST00000047285] [ENSMUST00000063502] [ENSMUST00000076599] [ENSMUST00000106823] [ENSMUST00000106824] [ENSMUST00000106832] [ENSMUST00000198752] [ENSMUST00000106834] [ENSMUST00000128716] [ENSMUST00000199710] [ENSMUST00000200377] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8C7W7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029435 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029435 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000047285 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000044262 Gene: ENSMUSG00000032952
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000063502 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000067695 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000076599 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000075904 Gene: ENSMUSG00000032952
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106823 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102436 Gene: ENSMUSG00000032952
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106824 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102437 Gene: ENSMUSG00000032952
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106832 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102445 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147894 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149374 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198835 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145893 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000199723 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000198752 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143067 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106834 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102447 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128716 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121063 Gene: ENSMUSG00000027845
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000199710 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143463 Gene: ENSMUSG00000105053
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200377 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143355 Gene: ENSMUSG00000032952
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Meta Mutation Damage Score | 0.0898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 95% (36/38) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] DNA interstrand cross-links prevent strand separation, thereby physically blocking transcription, replication, and segregation of DNA. DCLRE1B is one of several evolutionarily conserved genes involved in repair of interstrand cross-links (Dronkert et al., 2000 [PubMed 10848582]).[supplied by OMIM, Mar 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit reduced embryo size and neonatal lethality. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Dclre1b |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GTTGCGGGATATAGCAGCAG -3' (R):5'- CAGCTAATCCGACAGTTCCC -3' Sequencing Primer (F):5'- TTTAATTAACGACAAAGCTGGGG -3' (R):5'- CACAACACAACATAAAAATTGGTGAG -3' |
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Posted On | 2015-07-21 |