ID | 330450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Elavl2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000008489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ELAV like RNA binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mel-N1, Hub | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041730-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.412) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4473 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 91139000-91289022 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 91149246 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000102741 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000008633] [ENSMUST00000102799] [ENSMUST00000107109] [ENSMUST00000107109] [ENSMUST00000107110] [ENSMUST00000107111] [ENSMUST00000107111] [ENSMUST00000107116] [ENSMUST00000107116] [ENSMUST00000107118] [ENSMUST00000107118] [ENSMUST00000107120] [ENSMUST00000107120] [ENSMUST00000107124] [ENSMUST00000177109] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q60899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000008633 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000008633 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000102799 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000099863 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107109 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102726 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107109 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102726 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107110 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102727 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107111 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102728 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107111 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102728 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107116 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102733 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107116 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102733 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107118 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102735 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107118 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102735 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107120 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102737 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107120 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102737 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107124 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102741 Gene: ENSMUSG00000008489
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176469 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000177109 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135780 Gene: ENSMUSG00000008489
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Meta Mutation Damage Score | 0.9755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (36/36) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene is a neural-specific RNA-binding protein that is known to bind to several 3' UTRs, including its own and also that of FOS and ID. The encoded protein may recognize a GAAA motif in the RNA. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Elavl2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTGGGAAAGGATGGCCTGATTG -3' (R):5'- GGTTTCTTGACAAGCACACGG -3' Sequencing Primer (F):5'- TCTGGCCATTTAGGCCTT -3' (R):5'- GTAACCAGTGAGACCTCGCATTG -3' |
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Posted On | 2015-07-21 |